Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN2P49810 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms