Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTPAP49638 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTPAP49638 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTPAP49638 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTPAP49638 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTPAP49638 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTPAP49638 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTPAP49638 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTPAP49638 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTPAP49638 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTPAP49638 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTPAP49638 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTPAP49638 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTPAP49638 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTPAP49638 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTPAP49638 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTPAP49638 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTPAP49638 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTPAP49638 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTPAP49638 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTPAP49638 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTPAP49638 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTPAP49638 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTPAP49638 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTPAP49638 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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