Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POU3F4P49335 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms