Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT5P48643 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT5P48643 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT5P48643 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT5P48643 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT5P48643 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT5P48643 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT5P48643 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT5P48643 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT5P48643 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT5P48643 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT5P48643 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT5P48643 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT5P48643 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT5P48643 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT5P48643 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT5P48643 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT5P48643 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT5P48643 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT5P48643 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT5P48643 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms