Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRIP1P48552 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP1P48552 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms