Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A3P47895 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms