Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGRP47804 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGRP47804 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGRP47804 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGRP47804 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGRP47804 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGRP47804 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGRP47804 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGRP47804 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGRP47804 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGRP47804 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGRP47804 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGRP47804 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGRP47804 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGRP47804 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGRP47804 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGRP47804 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGRP47804 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGRP47804 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGRP47804 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGRP47804 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms