Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms