Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKN1BP46527 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms