Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-1P43699 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms