Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGER3P43115 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms