Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1BP42025 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1BP42025 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms