Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGDSP41222 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGDSP41222 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms