Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL1P40616 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL1P40616 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL1P40616 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL1P40616 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL1P40616 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL1P40616 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL1P40616 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL1P40616 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL1P40616 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL1P40616 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL1P40616 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL1P40616 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL1P40616 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL1P40616 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL1P40616 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL1P40616 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL1P40616 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL1P40616 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL1P40616 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARL1P40616 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARL1P40616 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARL1P40616 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARL1P40616 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARL1P40616 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARL1P40616 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARL1P40616 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARL1P40616 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARL1P40616 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL1P40616 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL1P40616 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARL1P40616 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARL1P40616 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARL1P40616 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARL1P40616 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARL1P40616 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARL1P40616 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms