Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 PCA1YBR295W 3651 nt4.56□□□□□ -1.68
PDR11P40550 NOP4YPL043W 2058 nt4.56□□□□□ -1.68
PDR11P40550 AIM17YHL021C 1398 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 MRPL11YDL202W 750 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 RIM9YMR063W 720 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 CBP3YPL215W 1008 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 ATG2YNL242W 4779 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 RIM21YNL294C 1602 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 RPN2YIL075C 2838 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 TPM1YNL079C 600 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 YBR226CYBR226C 411 nt4.55□□□□□ -1.68
PDR11P40550 DDC1YPL194W 1839 nt4.54□□□□□ -1.68
PDR11P40550 OSH3YHR073W 2991 nt4.54□□□□□ -1.68
PDR11P40550 NOP7YGR103W 1818 nt4.54□□□□□ -1.68
PDR11P40550 ZDS1YMR273C 2748 nt4.54□□□□□ -1.68
PDR11P40550 YNL320WYNL320W 855 nt4.54□□□□□ -1.68
PDR11P40550 GPR1YDL035C 2886 nt4.54□□□□□ -1.68
PDR11P40550 HOM3YER052C 1584 nt4.53□□□□□ -1.68
PDR11P40550 CIT3YPR001W 1461 nt4.53□□□□□ -1.68
PDR11P40550 MDM1YML104C 3384 nt4.53□□□□□ -1.68
PDR11P40550 FLO5YHR211W 3228 nt4.53□□□□□ -1.68
PDR11P40550 SNF2YOR290C 5112 nt4.53□□□□□ -1.68
PDR11P40550 YGL074CYGL074C 327 nt4.53□□□□□ -1.68
PDR11P40550 COS8YHL048W 1146 nt4.53□□□□□ -1.68
PDR11P40550 ALA1YOR335C 2877 nt4.52□□□□□ -1.69
PDR11P40550 SLD2YKL108W 1362 nt4.52□□□□□ -1.69
PDR11P40550 PRE4YFR050C 801 nt4.52□□□□□ -1.69
PDR11P40550 USB1YLR132C 873 nt4.52□□□□□ -1.69
PDR11P40550 DBP10YDL031W 2988 nt4.52□□□□□ -1.69
PDR11P40550 RAD54YGL163C 2697 nt4.52□□□□□ -1.69
PDR11P40550 MAK16YAL025C 921 nt4.51□□□□□ -1.69
PDR11P40550 SEC17YBL050W 879 nt4.51□□□□□ -1.69
PDR11P40550 YMR317WYMR317W 3423 nt4.51□□□□□ -1.69
PDR11P40550 PSE1YMR308C 3270 nt4.5□□□□□ -1.69
PDR11P40550 CDC14YFR028C 1656 nt4.5□□□□□ -1.69
PDR11P40550 WRS1YOL097C 1299 nt4.5□□□□□ -1.69
PDR11P40550 STI1YOR027W 1770 nt4.5□□□□□ -1.69
PDR11P40550 CHS5YLR330W 2016 nt4.5□□□□□ -1.69
PDR11P40550 APC11YDL008W 498 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR11P40550 RAI1YGL246C 1164 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR11P40550 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR11P40550 REE1YJL217W 597 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR11P40550 NAT3YPR131C 588 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR11P40550 THR4YCR053W 1545 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR11P40550 RBA50YDR527W 1320 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR11P40550 GCN5YGR252W 1320 nt4.49□□□□□ -1.69
PDR11P40550 ESF1YDR365C 1887 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR11P40550 OMS1YDR316W 1416 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR11P40550 NHP10YDL002C 612 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR11P40550 CAX4YGR036C 720 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR11P40550 RPL15AYLR029C 615 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR11P40550 VPS21YOR089C 633 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR11P40550 ECM21YBL101C 3354 nt4.48□□□□□ -1.69
PDR11P40550 YNL247WYNL247W 2304 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR11P40550 YAL004WYAL004W 648 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR11P40550 NIS1YNL078W 1224 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR11P40550 snR42snR42 351 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR11P40550 SWP82YFL049W 1872 nt4.47□□□□□ -1.69
PDR11P40550 RPS11AYDR025W 471 nt4.46□□□□□ -1.69
PDR11P40550 TRP4YDR354W 1143 nt4.46□□□□□ -1.69
PDR11P40550 RPL30YGL030W 318 nt4.46□□□□□ -1.69
PDR11P40550 ARP1YHR129C 1155 nt4.46□□□□□ -1.69
PDR11P40550 YKL050CYKL050C 2769 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR11P40550 UBP7YIL156W 3216 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR11P40550 HAT2YEL056W 1206 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR11P40550 ENT3YJR125C 1227 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR11P40550 GRE1YPL223C 507 nt4.46□□□□□ -1.7
PDR11P40550 SLN1YIL147C 3663 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR11P40550 ASI1YMR119W 1875 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR11P40550 POL3YDL102W 3294 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR11P40550 TRS85YDR108W 2097 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR11P40550 SGT1YOR057W 1188 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR11P40550 ECM22YLR228C 2445 nt4.45□□□□□ -1.7
PDR11P40550 MEC3YLR288C 1425 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR11P40550 BLM10YFL007W 6432 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR11P40550 TMN2YDR107C 2019 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR11P40550 YDL023CYDL023C 321 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR11P40550 RRP46YGR095C 672 nt4.44□□□□□ -1.7
PDR11P40550 DBP3YGL078C 1572 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR11P40550 YHR202WYHR202W 1809 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR11P40550 RAD26YJR035W 3258 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR11P40550 RPO21YDL140C 5202 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR11P40550 YLR156WYLR156W 345 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR11P40550 YLR159WYLR159W 345 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR11P40550 YLR161WYLR161W 345 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR11P40550 TEM1YML064C 738 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR11P40550 HOS1YPR068C 1413 nt4.43□□□□□ -1.7
PDR11P40550 PAM1YDR251W 2493 nt4.42□□□□□ -1.7
PDR11P40550 RPL8BYLL045C 771 nt4.42□□□□□ -1.7
PDR11P40550 YPL216WYPL216W 3309 nt4.42□□□□□ -1.7
PDR11P40550 YGR266WYGR266W 2106 nt4.42□□□□□ -1.7
PDR11P40550 TYW1YPL207W 2433 nt4.42□□□□□ -1.7
PDR11P40550 RAD1YPL022W 3303 nt4.42□□□□□ -1.7
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