Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms