Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF1P36956 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms