Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms