Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE6BP35913 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6BP35913 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6BP35913 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6BP35913 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6BP35913 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6BP35913 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDE6BP35913 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6BP35913 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6BP35913 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE6BP35913 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE6BP35913 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE6BP35913 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE6BP35913 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE6BP35913 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PDE6BP35913 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE6BP35913 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE6BP35913 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE6BP35913 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE6BP35913 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE6BP35913 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE6BP35913 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE6BP35913 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE6BP35913 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE6BP35913 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6BP35913 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE6BP35913 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE6BP35913 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE6BP35913 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE6BP35913 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms