Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPB2P35606 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPB2P35606 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPB2P35606 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPB2P35606 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPB2P35606 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPB2P35606 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPB2P35606 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPB2P35606 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPB2P35606 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPB2P35606 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPB2P35606 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPB2P35606 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPB2P35606 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPB2P35606 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPB2P35606 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPB2P35606 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COPB2P35606 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPB2P35606 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB2P35606 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB2P35606 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB2P35606 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB2P35606 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB2P35606 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB2P35606 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB2P35606 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPB2P35606 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPB2P35606 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPB2P35606 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPB2P35606 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPB2P35606 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms