Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms