Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC1P33527 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ABCC1P33527 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC1P33527 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms