Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC8A1P32418 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC8A1P32418 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms