Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA3P32297 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms