Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTX2P32243 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OTX2P32243 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTX2P32243 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTX2P32243 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTX2P32243 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTX2P32243 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTX2P32243 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTX2P32243 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTX2P32243 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTX2P32243 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OTX2P32243 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OTX2P32243 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
OTX2P32243 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
OTX2P32243 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OTX2P32243 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OTX2P32243 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OTX2P32243 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms