Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms