Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF1P30408 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM4SF1P30408 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms