Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL4A5P29400 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A5P29400 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A5P29400 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms