Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2E2P29084 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms