Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPA1P27694 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPA1P27694 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA1P27694 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA1P27694 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA1P27694 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA1P27694 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA1P27694 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA1P27694 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA1P27694 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA1P27694 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPA1P27694 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPA1P27694 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPA1P27694 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA1P27694 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA1P27694 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA1P27694 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA1P27694 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA1P27694 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPA1P27694 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPA1P27694 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPA1P27694 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPA1P27694 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPA1P27694 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA1P27694 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA1P27694 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA1P27694 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA1P27694 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA1P27694 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPA1P27694 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA1P27694 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA1P27694 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA1P27694 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPA1P27694 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms