Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DNMT1P26358 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms