Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR3P22607 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms