Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME2P22392 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME2P22392 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME2P22392 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME2P22392 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME2P22392 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME2P22392 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME2P22392 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME2P22392 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME2P22392 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME2P22392 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NME2P22392 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME2P22392 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME2P22392 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms