Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EPHA1P21709 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms