Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP1P21291 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP1P21291 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP1P21291 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRP1P21291 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSRP1P21291 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms