Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGCP20142 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGCP20142 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGCP20142 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGCP20142 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGCP20142 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGCP20142 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGCP20142 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGCP20142 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGCP20142 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGCP20142 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PGCP20142 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGCP20142 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGCP20142 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGCP20142 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGCP20142 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGCP20142 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGCP20142 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGCP20142 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGCP20142 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGCP20142 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGCP20142 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGCP20142 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGCP20142 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGCP20142 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGCP20142 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGCP20142 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGCP20142 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms