Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms