Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG1P18858 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG1P18858 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG1P18858 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG1P18858 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG1P18858 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG1P18858 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG1P18858 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIG1P18858 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG1P18858 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG1P18858 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG1P18858 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG1P18858 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG1P18858 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG1P18858 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG1P18858 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG1P18858 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIG1P18858 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIG1P18858 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIG1P18858 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIG1P18858 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LIG1P18858 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIG1P18858 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG1P18858 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG1P18858 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG1P18858 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG1P18858 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG1P18858 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG1P18858 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG1P18858 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG1P18858 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms