Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPN2P17655 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms