Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB4P17483 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms