Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPB42P16452 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPB42P16452 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPB42P16452 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPB42P16452 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPB42P16452 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPB42P16452 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPB42P16452 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms