Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD44P16070 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CD44P16070 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD44P16070 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD44P16070 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD44P16070 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD44P16070 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD44P16070 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD44P16070 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD44P16070 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD44P16070 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD44P16070 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD44P16070 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD44P16070 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD44P16070 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD44P16070 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD44P16070 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD44P16070 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD44P16070 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD44P16070 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD44P16070 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD44P16070 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD44P16070 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD44P16070 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD44P16070 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD44P16070 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD44P16070 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD44P16070 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD44P16070 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD44P16070 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD44P16070 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD44P16070 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD44P16070 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD44P16070 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD44P16070 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD44P16070 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD44P16070 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD44P16070 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CD44P16070 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD44P16070 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD44P16070 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD44P16070 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CD44P16070 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD44P16070 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD44P16070 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD44P16070 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD44P16070 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD44P16070 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD44P16070 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD44P16070 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD44P16070 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms