Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME1P15531 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME1P15531 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME1P15531 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME1P15531 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME1P15531 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME1P15531 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME1P15531 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME1P15531 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME1P15531 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME1P15531 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME1P15531 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME1P15531 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME1P15531 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME1P15531 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME1P15531 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME1P15531 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME1P15531 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME1P15531 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME1P15531 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME1P15531 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME1P15531 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME1P15531 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME1P15531 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NME1P15531 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME1P15531 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME1P15531 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME1P15531 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME1P15531 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME1P15531 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME1P15531 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME1P15531 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME1P15531 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NME1P15531 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME1P15531 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms