Protein–RNA interactions for Protein: P15382

KCNE1, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE1P15382 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNE1P15382 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNE1P15382 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNE1P15382 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNE1P15382 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNE1P15382 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNE1P15382 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNE1P15382 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms