Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms