Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NID1P14543 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NID1P14543 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NID1P14543 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NID1P14543 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NID1P14543 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NID1P14543 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NID1P14543 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NID1P14543 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NID1P14543 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NID1P14543 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NID1P14543 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NID1P14543 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NID1P14543 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NID1P14543 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NID1P14543 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NID1P14543 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NID1P14543 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NID1P14543 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NID1P14543 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NID1P14543 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NID1P14543 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NID1P14543 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NID1P14543 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms