Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT1P13805 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT1P13805 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT1P13805 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms