Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARGP13631 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RARGP13631 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARGP13631 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARGP13631 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARGP13631 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARGP13631 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARGP13631 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RARGP13631 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARGP13631 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARGP13631 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARGP13631 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARGP13631 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARGP13631 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARGP13631 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARGP13631 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARGP13631 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARGP13631 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RARGP13631 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARGP13631 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARGP13631 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARGP13631 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARGP13631 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARGP13631 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARGP13631 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARGP13631 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARGP13631 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARGP13631 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARGP13631 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARGP13631 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RARGP13631 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RARGP13631 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARGP13631 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARGP13631 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARGP13631 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARGP13631 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms