Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD8P13378 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD8P13378 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms