Protein–RNA interactions for Protein: P12544

GZMA, Granzyme A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMAP12544 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GZMAP12544 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GZMAP12544 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GZMAP12544 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GZMAP12544 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GZMAP12544 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GZMAP12544 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GZMAP12544 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GZMAP12544 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GZMAP12544 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GZMAP12544 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GZMAP12544 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GZMAP12544 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GZMAP12544 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GZMAP12544 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms